Pico488 DNA 定量溶液是一種超靈敏試劑,用於(yu) 在無法通過測量 260 nm 吸光度來確定雙鏈 DNA 濃度時測量雙鏈 DNA 濃度。 Pico488 選擇性地結合雙鏈 DNA,因此核苷酸、單鏈 DNA、RNA、蛋白質和其他雜質不會(hui) 妨礙測量。與(yu) 雙鏈 DNA 結合的染料在 503 nm 處最大吸收光並在 525 nm 處最大發射光。為(wei) 了檢測測定讀數,可以使用任何類型的熒光計或熒光板讀數器。
Pico488 測量 DNA 濃度的線性範圍為(wei) 1 pg/μL — 5 ng/μL。為(wei) 了實現精確、可重複的熒光測量,我們(men) 建議在 TE 緩衝(chong) 液(10 mM Tris-HCl,pH 7.5,1 mM EDTA)中稀釋 DNA 和 Pico488。為(wei) 了計算 DNA 濃度,我們(men) 建議首先使用一係列 DNA 標準稀釋液建立校準曲線。
Lumprobe 銷售各種包裝的Pico488 DNA 定量溶液和Pico488 DNA 定量試劑盒。除了 Pico488 溶液之外,該試劑盒還包括緩衝(chong) 液和 DNA 標準儲(chu) 備溶液。如果測定體(ti) 積等於(yu) 2 ml,則試劑盒提供的染料溶液量足以分析標準熒光比色皿(體(ti) 積 3.5 ml)中的 200 個(ge) 實驗數據點。如果使用其他類型的設備來檢測熒光,則可以重新調整測定範圍。下表提供了常用熒光設備的推薦檢測體(ti) 積。
解凍 Pico488 染料瓶中的內(nei) 容物,充分混合,並用緩衝(chong) 液將所需量的 Pico488 染料溶液稀釋 200 倍(我們(men) 建議使用 10 mM Тris HCl、1 mM EDTA,pH 7.5)。混合並在3小時內(nei) 使用。每個(ge) 實驗數據點的 Pico488 工作溶液體(ti) 積應等於(yu) 測定體(ti) 積的 50%(查看下表以查找適合您的熒光測定設備類型的推薦體(ti) 積)。為(wei) 所有實驗數據點(針對您計劃分析的所有樣品和所有 DNA 標準稀釋液)準備足夠的 Pico488 工作溶液。還包括額外 10-25% 的 Pico488 工作溶液體(ti) 積,以排除可能的移液錯誤。要計算稀釋後的 Pico448 的體(ti) 積,可以使用以下公式:
V Pico488 = 5/8 × V測定× (N 個(ge) 樣品+ N 個(ge) 標準品), 其中 V測定是樣品或標準品的測定體(ti) 積,mL,N 個(ge) 樣品 是您計劃分析的樣品數量,N 個(ge) 標準品是您計劃分析的標準品數量(包括空白樣品)。
在緩衝(chong) 液中稀釋 DNA 樣本,使溶液體(ti) 積等於(yu) 測定體(ti) 積的 50%(您可以使用任意量的 DNA)。添加等體(ti) 積的 Pico488 工作溶液。混合並孵育 5 分鍾。同樣,製備 DNA 標準品的稀釋液。請注意,DNA 標準品的稀釋度應在樣品中 DNA 濃度的範圍內(nei) 。 DNA 標準儲(chu) 備液僅(jin) 隨Pico488 DNA 定量試劑盒提供。Pico488 DNA 定量解決(jue) 方案的用戶 應使用自己的 DNA 標準品。
使用Pico488 DNA 定量溶液進行 DNA 定量的推薦體(ti) 積:
設備類型 | 測定體積 | 稀釋後的 Pico488 體積 | 稀釋 DNA 體積 |
---|---|---|---|
標準熒光比色皿(3.5 ml) | 2毫升 | 1毫升 | 1毫升 |
其他熒光比色皿 | 約比色皿體積的 75% | 比色皿體積的 37.5% | 比色皿體積的 37.5% |
96 孔板*,每孔 | 0.2毫升 | 0.1毫升 | 0.1毫升 |
24 孔板,每孔 | 1毫升 | 0.5毫升 | 0.5毫升 |
其他板材 | 約占井容積的75% | 井體積的37.5% | 井體積的37.5% |
NanoDrop™ 3300* | 0.1毫升 | 0.05毫升 | 0.05毫升 |
* 為(wei) 了保持測量的準確性和精密度,我們(men) 建議避免移液量低於(yu) 2 µL。
使用適當的吸收和發射波長或濾光片測量標準和樣品 DNA 溶液的熒光(雙鏈 DNA 結合的 Pico488 染料吸收最大波長為(wei) 503 nm 的光,發射最大波長為(wei) 525 nm 的光)。
繪製熒光與(yu) 濃度的關(guan) 係圖,並在任何軟件中應用線性回歸函數,以獲得反映熒光 ( FL ) 與(yu) 濃度 ( C ) 依賴性的線性方程:
FL = A × C + B。
要計算稀釋樣品中的 DNA 濃度,請使用以下公式:
C樣品= (FL樣品 — B)/A,其中FL樣品是樣品溶液熒光。
要計算未稀釋樣品中的 DNA 濃度,請使用以下公式:
С init = V Assay × C Sample / V init,其中 V Assay是測定體(ti) 積(mL),V init是初始 DNA 樣品的體(ti) 積(μL)
或者,您可以使用我們(men) 的dsDNA 定量和稀釋 計算器完成所有必要的計算。