蛋白質標記緩衝(chong) 液適用於(yu) CuAAC 與(yu) 蛋白質的反應,可保護生物分子免受活性氧的損害。該反應可用於(yu) 具有炔烴或疊氮基團的蛋白質,以及用疊氮基團代謝標記的細胞或細胞裂解物的組分。
疊氮化物與(yu) 末端炔烴綴合,形成五元雜環(1,2,3-三唑)。這兩(liang) 個(ge) 基團(疊氮基和炔烴)在天然生物分子中都極為(wei) 罕見,因此該反應具有高度特異性,可以有效地處理各種任務。
該反應在銅 (I) 化合物存在下進行,幾乎不依賴於(yu) pH 值。蛋白質標記緩衝(chong) 液針對蛋白質操作進行了優(you) 化,含有銅 (II) 鹽(催化活性銅 (I) 化合物的穩定前體(ti) )、醋酸三乙銨 pH 6.8、水溶性 THPTA 配體(ti) 和氨基胍。建議使用新鮮配製的 抗壞血酸溶液減少銅(II)。蛋白質標記緩衝(chong) 液中的 THPTA 配體(ti) 通過穩定銅 (I) 的催化活性化合物來加速反應。 THPTA 配體(ti) 的存在還允許在水介質(無有機溶劑)中進行蛋白質標記,並且由於(yu) 銅 (I) 氧化程度的穩定,最大限度地減少活性氧 (RAS) 的產(chan) 生,並防止它們(men) 通過氧化組氨酸、蛋氨酸來損壞蛋白質和半胱氨酸。蛋白質標記緩衝(chong) 液中的氨基胍可防止化學反應性醛(脫氫抗壞血酸水解產(chan) 物)與(yu) 精氨酸、N 末端半胱氨酸和賴氨酸的側(ce) 鏈結合。
對於(yu) 此反應,您將需要無疊氮鈉緩衝(chong) 液中的炔烴或疊氮化物修飾的蛋白質、疊氮染料或 炔烴、1.5х蛋白質標記緩衝(chong) 液和抗壞血酸。建議在惰性氣體(ti) (氮氣或氬氣)下執行步驟 6 至 9。
我們(men) 推薦以下方案用於(yu) 修飾蛋白質與(yu) 染料衍生物的綴合:
根據要使用的修飾蛋白的量確定總反應體(ti) 積:
!炔烴或疊氮化物修飾的蛋白質溶液的體(ti) 積不應超過總反應體(ti) 積的1/3。
總反應體積,μL | 蛋白質含量 |
---|---|
100 | 4至20納摩爾 |
200 | 20至40納摩爾 |
400 | 40至80納摩爾 |
600 | 80 至 600 納摩爾 |
使用下表計算標記反應的試劑體(ti) 積:
試劑 | 體積,微升 | 原液濃度 |
---|---|---|
染料疊氮化物或炔烴 | (蛋白質含量 [nmol])× 0.3* | 10 mM DMSO 或水 |
蛋白質標記緩衝液 | (總反應體積[μL])×0.67 | 1.5倍 |
活化劑(抗壞血酸) | (總反應體積[μL])×0.02 | 50 mM 水中 |
水 | (總反應體積 [μL] – 染料溶液體積 [μL] – 蛋白質標記緩衝液體積 [μL] – 活化劑溶液體積 [μL]) | — |
* 染料過量可能會(hui) 根據蛋白質分子上疊氮化物或炔基的數量而變化。表中顯示的計算結果為(wei) 3 倍過量的染料。對於(yu) 1.5–10 倍過量的染料,將蛋白質含量 (nmol) 乘以 0.15–1。但請記住,如果您使用不溶於(yu) 水的疊氮化物或炔烴,則過量時它可能會(hui) 從(cong) 反應混合物中沉澱出來。使用水溶性染料,例如磺化花青染料sulfo-Cyanine。
準備 染料疊氮化物或炔烴(10 mM 溶於(yu) DMSO 或水中,適用於(yu) 水溶性炔烴和疊氮化物)和活化劑(抗壞血酸,50 mM 水溶液)的儲(chu) 備溶液。
請記住,抗壞血酸在空氣中很容易氧化。僅(jin) 使用新配製的活化劑溶液 (該溶液在 1 天內(nei) 穩定)。要製備儲(chu) 備溶液,請將 10 mg 抗壞血酸溶解在 1.1 mL 水中。
將蛋白質標記緩衝(chong) 液添加到修飾的蛋白質溶液中並渦旋。
添加計算體(ti) 積的疊 氮化染料或炔烴儲(chu) 備溶液,並再次渦旋均勻。
(推薦)對混合物進行脫氣以除去氧氣。為(wei) 此,將一次性移液器吸頭連接到塑料或矽膠管,該管連接到裝有惰性氣體(ti) (氬氣或氮氣)的氣瓶的壓力調節器。打開非常弱的氣流,放入管中,使其比液麵高 3-10 毫米,避免接觸液體(ti) 和管壁。氣流應在液體(ti) 中形成漩渦而不濺出液體(ti) 。將保持在該位置 10-20 秒。
如果同時進行多個(ge) 標記反應,可以使用離心濃縮器進行脫氣。為(wei) 此,將管子放入濃縮器中,打開旋轉,打開真空 30-40 秒,然後關(guan) 閉真空,同時向係統輸入端輸送惰性氣體(ti) 。
添加活化劑溶液(抗壞血酸),然後用惰性氣體(ti) 吹掃管幾秒鍾並關(guan) 閉它。
渦旋溶液。
讓混合物在室溫下靜置 8-16 小時。
使用透析或尺寸排阻色譜分離染料-蛋白質綴合物。