Nanobind UL library prep kit，產品型號：900-601-01 。

Nanobind UL library prep kit，描述：

高通量和超長讀取(100 kb-1+Mb)現在齊頭並進，可以成為(wei) 您實驗室的常客與(yu) Nanobind超長測序。該方法已被用於(yu) 生成長的測序數據。我們(men) 在2020年1月以2.44 Mb的讀取量打破了之前的2.3 Mb記錄。幾個(ge) 月後，我們(men) 以290萬(wan) 的讀取量打破了這一記錄。最近，牛津納米孔以他們(men) 自己的4.1 Mb的讀取量打破了我們(men) 的記錄。

最高的讀長度和吞吐量組合

與(yu) 以前的超長測序方法相比，這種新方法的吞吐量提高了10-100倍。在廣泛的樣本類型中，始終獲得1-2+Mb的最長讀取，50-100+kb的讀取長度N50，以及10-20+Gb的MinION吞吐量和50-100+Gb的PromethION吞吐量。

此方法旨在100+kb和200+kb讀取的數據量。雖然該方法可以用於(yu) 生成超過200 kb的讀取長度N50，但超長數據吞吐量實際上可以通過更溫和的讀取長度N50 (50-100 kb)。秘訣在於(yu) 保持高毛孔占有率。

該方法

首先，使用適當的Nanobind試劑盒(CBB，植物核或組織)提取UHMW(50 kb1+Mb)DNA。我們(men) 開發了全新的UHMW DNA提取方案，從(cong) 而降低了DNA的粘性，提高了測序吞吐量，甚至延長了讀取長度。

每個(ge) Nanobind UL庫準備套件配有一個(ge) UHMW DNA輔助套件，與(yu) 適當的Nanobind套件一起用於(yu) UHMW DNA提取。

然後，將Nanobind UL文庫準備試劑盒與(yu) Oxford Nanopore超長DNA測序試劑盒(SQK-ULK001)結合使用，製備UHMW DNA進行測序。基於(yu) 轉座酶的方法用於(yu) 將測序適配器和馬達蛋白添加到UHMW DNA中。ONT試劑盒包含所有酶和試劑。我們(men) 的工具包包含Nanobind磁盤和緩衝(chong) 區執行反應清理。與(yu) 磁性顆粒不同，我們(men) 的磁性Nanobind磁盤可以在不剪切的情況下快速純化兆酶DNA，首先在提取中，然後在文庫準備中。

與(yu) 其他超長測序方法相比，這種新方法不使用快速測序試劑盒(SQK-RAD004)。與(yu) Oxford Nanopore合作，對提取、文庫準備和測序進行了基礎優(you) 化，以實現高孔隙占有率，從(cong) 而大幅提高產(chan) 量。它與(yu) MinION, GridION和PromethION兼容，並對核酸酶衝(chong) 洗反應良好。

標準的Nanobind超長測序協議生成一個(ge) 6倍的MinION庫或3倍的PromethION庫，該庫被拆分並按順序加載到相同的流式細胞上，通過核酸酶衝(chong) 洗間隔以最大限度地提高吞吐量(每個(ge) 流式細胞3次加載，每次24小時)。MinION/GridION/PromethION使用相同的協議。

該方案最初是在培養(yang) 的細胞、細菌、人血和有核血液樣本上開發的。從(cong) 那時起，它已經擴展到動物組織和植物樣本。改進讀取長度和進一步擴大樣本類型的工作正在進行中。

包括:

1.NAF無醇結合緩衝(chong) 液

2.WAF無酒精洗滌緩衝(chong) 液

3.EB +洗脫緩衝(chong)

4.6x Nanobind磁盤

每個(ge) 套件可用於(yu) 運行6個(ge) 流單元，使用3X庫。

還包括與(yu) 適當的Nanobind試劑盒結合使用的UHMW DNA輔助試劑盒，以執行UHMW DNA提取。每個(ge) 輔助套件包含:

1.10X 紅細胞裂解緩衝(chong) 液

2. 蛋白酶K

3.核糖核酸酶一

4.CLE3消化緩衝(chong) 液

5.ULL裂解/結合緩衝(chong) 液

6.CS消化補充劑

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