亞(ya) 磷酰胺,也稱為(wei) amidite,是一種用於(yu) 合成寡核苷酸的化合物,寡核苷酸是短鏈核苷酸。它們(men) 由連接到亞(ya) 磷酰胺基團的核苷堿基(腺嘌呤、鳥嘌呤、 胞嘧啶、胸腺嘧啶或尿嘧啶)組成,亞(ya) 磷酰胺基團能夠在合成過程中與(yu) 不斷增長的核苷酸鏈形成共價(jia) 鍵合。
亞(ya) 磷酰胺主要用於(yu) 構建寡核苷酸序列的過程,該過程分為(wei) 多個(ge) 步驟,通常為(wei) 三步或四步。每個(ge) 步驟都涉及特定的反應和純化步驟,以將單個(ge) 核苷酸添加到不斷增長的寡核苷酸鏈中並組裝所需的更長序列。在合成過程中,亞(ya) 酰胺被激活並附著在固體(ti) 載體(ti) 上,例如樹脂或玻璃珠。通過一係列偶聯、脫保護和洗滌步驟,寡核苷酸鏈按照預先定義(yi) 的 amidites 序列一次延長一個(ge) 核苷酸。合成完成後,寡核苷酸從(cong) 固體(ti) 支持物上釋放並純化以供進一步應用(圖1)。
該過程已通過高通量合成器和固相合成技術的進步實現自動化,從(cong) 而能夠更快、更高效地生產(chan) 合成寡核苷酸。這種自動化方法能夠快速、高效地合成用於(yu) 各種應用的定製寡核苷酸,例如 DNA 測序、基因合成和分子診斷。
最近,弗萊堡大學的 ABMS 實驗室提出了一鍋液相合成技術,該技術涉及在單個(ge) 反應容器或係統內(nei) 發生的整個(ge) 過程,無需在核苷酸添加之間進行中間純化步驟,從(cong) 而簡化了過程減少總體(ti) 合成時間。在這種方法中,所需的核苷酸、亞(ya) 酰胺和試劑組合在一起,並經曆一係列反應和條件,同時促進偶聯和脫保護(圖 2)。
該方法具有簡單和快速的優(you) 點,但與(yu) 傳(chuan) 統的逐步合成方法相比,實現高純度和產(chan) 率可能具有挑戰性。兩(liang) 種技術之間的選擇取決(jue) 於(yu) 所需的寡核苷酸長度、序列複雜性、時間限製以及研究或應用的具體(ti) 要求等因素。研究人員在決(jue) 定采用哪種方法時會(hui) 考慮成本、效率、可擴展性和產(chan) 品純度等因素。