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DNA純化方法和流程概述?

更新時間:2023-12-28      點擊次數:857

BiteSizeBio列出了“清理 DNA 樣本的 5 種方法"。在某種程度上,這個(ge) 總結是過時的並且具有誤導性。讓我們(men) 來看看它們(men) 是如何工作的。

  1. 苯酚-氯仿萃取以去除蛋白質。將 DNA 溶液與(yu) 苯酚和氯仿混合。水溶性 DNA 分配到水相中,而蛋白質在有機溶劑存在下變性,從(cong) 而留在有機相中。

  2. 乙醇沉澱脫鹽。在 DNA 提取中,鹽通過破壞將核酸固定在一起的蛋白質鏈來釋放 DNA 鏈。由於(yu) DNA 不溶於(yu) 乙醇。在乙醇溶液中,鹽使 DNA 不易溶於(yu) 水,同時有助於(yu) 保持蛋白質(有機小分子)溶解在水中。結果是,DNA 分子聚集並從(cong) 溶液中沉澱出來。

  3. 基於(yu) 矽膠柱,使用矽膠或矽膠珠和離液鹽。離液鹽會(hui) 破壞鏈之間的氫鍵,促進 DNA 與(yu) 二氧化矽的結合以及與(yu) 樣品其餘(yu) 部分的分離。

  4. 陰離子交換使用帶正電荷的 DEAE 功能化樹脂結合帶負電荷的 DNA 磷酸主鏈。

  5. 磁珠使用磁珠以 pH 依賴性方式有條件地結合 DNA,讓您隻需控製 pH 即可將 DNA 與(yu) 樣品的其餘(yu) 部分分離。磁珠帶正電,在低 pH 條件下結合 DNA,但在高 pH 條件下,它們(men) 帶負電荷,從(cong) 而釋放 DNA。

前兩(liang) 個(ge) 實際上是稱為(wei) 有機提取的DNA 提取方法的一部分,該方法包括裂解步驟、苯酚氯仿提取、乙醇沉澱和洗滌步驟。

後 3 個(ge) 用於(yu) DNA 清理。所有步驟都包括結合、洗滌和洗脫步驟。其中基於(yu) 磁珠的方法,因為(wei) 不需要離心和其他耗時的處理步驟。它是高通量處理自動化的理想選擇。由於(yu) 它是現在的主流方法,珠子的成本在過去十年中下降了一半。

如何淨化DNA?

MagVigen DNA 純化工作流程

圖 3. DNA 純化工作流程。


  1. 混合:將納米顆粒與(yu) DNA 樣品混合。


  2. 結合:當與(yu) 樣品混合時,納米粒子與(yu) 目標 DNA 樣品結合。


  3. 清洗:使用磁力(例如磁力分離架)來拉動和聚集結合的材料。通過抽吸去除未結合的材料,剩下的是納米顆粒結合的目標。


  4. 洗脫:從(cong) 納米顆粒中釋放結合的目標樣品。清潔後的 DNA 樣品即可用於(yu) 下遊應用。


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