RNA 測序 (RNA-seq) 是一項革命性技術,改變了基因組學領域。它為(wei) 研究人員揭示細胞和分子水平上發生的許多複雜過程開辟了新途徑。與(yu) DNA 測序不同,RNA-seq 通過提供任何給定時間所有活性基因的快照來深入了解基因組的功能元件。那麽(me) ,這如何幫助用戶對不同的細胞類型進行分類呢?請繼續閱讀以了解更多信息。
RNA 測序已成為(wei) 細胞類型分類的強大工具。它使科學家能夠識別特定的細胞類型並了解它們(men) 在各種生物過程中的作用。這是因為(wei) RNA-seq 能夠分析單個(ge) 細胞中的基因表達水平。許多研究領域都將從(cong) 這種開創性的方法中受益,但它在研究肺纖維化等疾病方麵已經顯示出非凡的潛力,在這些疾病中,不同細胞群的作用尚未全了解。
單細胞 RNA 測序 (scRNA-seq) 將 RNA 測序提升到一個(ge) 新水平。它使科學家能夠分析單個(ge) 細胞的轉錄組,提供細胞類型和狀態的高分辨率視圖。與(yu) 傳(chuan) 統的 RNA 測序方法相比,這是一個(ge) 重大進步,傳(chuan) 統的 RNA 測序方法提供大量細胞的平均基因表達譜。
在最近一項題為(wei) “單細胞 RNA 測序揭示肺纖維化中不同上皮和間質譜係的促纖維化作用"的研究中,scRNA-seq 被用來揭示肺纖維化的複雜細胞景觀。該研究使用 10x Genomics Chromium 平台進行單細胞 RNA 測序,該平台生成乳液中的單細胞凝膠珠 (GEM),用於(yu) 逆轉錄過程以創建 cDNA。然後對該 cDNA 進行擴增並用於(yu) 測序。
DeNovix DS-11 FX+ 分光光度計/熒光計在這項研究中發揮了至關(guan) 重要的作用。該儀(yi) 器用於(yu) 定量 RNA,這是 RNA 測序過程中的關(guan) 鍵步驟。RNA的定量確保了測序過程有足夠的材料,並有助於(yu) 保證樣品的質量。這是 10x Genomics 平台單細胞 RNA 測序的準備步驟。
細胞計數是 RNA 測序的另一個(ge) 重要準備步驟。在一項相關(guan) 研究“模擬人類肺細胞暴露於(yu) 野火中發現異常的 lncRNA 特征"中,DeNovix CellDrop™ 係統用於(yu) 在 0.4% 台盼藍 1:1 稀釋液中對人類永生化支氣管氣管細胞 (AALE) 進行計數,並在其死亡前 24 小時進行計數。直接煙霧暴露(DSE)。暴露於(yu) 氣液界麵 (ALI) 室後,細胞用於(yu) RNA 測序分析,以識別 IncRNA 的變化。結果表明煙霧成分對於(yu) 野火煙霧的分子效應的重要性。具體(ti) 來說:
“我們(men) 的結果闡明了化學成分(以及地理來源)在評估野火煙霧暴露可能導致的呼吸係統健康風險方麵的重要性。我們(men) 使用通過實驗生成的 RNA-seq 數據進行公正的分析,旨在識別差異表達的轉錄本,在這裏,通過嚴(yan) 格和全局的分析,我們(men) 證明不同的野火煙霧會(hui) 誘導 lncRNA 的異常表達。"
機器學習(xi) 是另一種越來越多地與(yu) RNA 測序結合使用的工具。通過訓練已知細胞類型的數據,機器學習(xi) 算法可以根據細胞類型的基因表達譜對細胞類型進行分類。這可以大大提高細胞類型分類的準確性和效率。
RNA-seq 的應用廣泛且多樣。從(cong) 了解疾病中細胞群的複雜性到發現選擇性剪接變體(ti) ,RNA-seq 是現代基因組學庫中的多功能工具。
隨著新技術和方法的不斷開發,RNA測序的未來是光明的。對不同 RNA 分子及其表達水平的研究不斷增長,這將與(yu) RNA-seq 的進步契合,並擴大我們(men) 可以理解的細胞類型的數量。
在 DeNovix,我們(men) 很自豪能夠成為(wei) 這個(ge) 令人興(xing) 奮的領域的一部分。我們(men) 邀請您探索我們(men) 的產(chan) 品和服務範圍,並與(yu) 我們(men) 一起突破 RNA 測序的可能界限。使用我們(men) 的組合分光光度計/熒光計和開創性的自動細胞計數器,用戶可以優(you) 化 RNA 測序的準備步驟,以保證最高的質量。我們(men) 可以一起繼續解開細胞的秘密,並在分子水平上增進我們(men) 對生命的理解。