鮑曼不動杆菌基因組DNA基本信息
培養(yang) 基 | 蛋白腖:10.0,牛肉粉:3.0,氯化鈉:5.0,瓊脂:15.0,pH值:7.3±0.1(25℃) |
傳(chuan) 代方法 | 使用前請先在緩衝(chong) 液GD和漂洗液PW中加入無水乙醇,加入體(ti) 積請參照瓶上的標簽; 1.取細菌培養(yang) 液1-5ml,10,000rpm(11,500×g)離心1min,盡量吸淨上清; 2.向菌體(ti) 沉澱中加入200μL緩衝(chong) 液GA,振蕩至菌體(ti) 徹di懸浮。注意:對於(yu) 較難破壁的革蘭(lan) 氏陽性菌,可略過第2步驟,加入溶菌酶溶液進行破壁處理,具體(ti) 方法為(wei) :加入110μL緩衝(chong) 液(20mM Tris,pH8.0;2mM Na2-EDTA;1.2%Triton),和70μL溶菌酶溶液(50mg/mL,客戶自備,目錄號:RT401),37℃處理30min以上。如果需要去除RNA,可加入4μL RNase A(100mg/mL)溶液(客戶自備,目錄號:RT405-12),振蕩15sec,室溫放置5min; 3.向管中加入20μL Proteinase K溶液,混勻; 4.加入220μL緩衝(chong) 液GB,振蕩15sec,70℃放置10min,溶液應變清亮,簡短離心以去除管蓋內(nei) 壁的水珠。注意:加入緩衝(chong) 液GB時可能會(hui) 產(chan) 生白色沉澱,一般70℃放置時會(hui) 消失,不會(hui) 影響後續實驗。如溶液未變清亮,說明細胞裂解不徹di,可能導致提取DNA量少和提取出的DNA不純; 5.加220μL無水乙醇,充分振蕩混勻15sec,此時可能會(hui) 出現絮狀沉澱,簡短離心以去除管蓋內(nei) 壁的水珠; 6.將上一步所得溶液和絮狀沉澱都加入一個(ge) 吸附柱CB3中(吸附柱放入收集管中),12,000rpm(13,400×g)離心30sec,倒掉廢液,將吸附柱CB3放入收集管中; 7.向吸附柱CB3中加入500μL緩衝(chong) 液GD(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),12,000rpm(13,400×g)離心30sec,倒掉廢液,將吸附柱CB3放入收集管中; 8.向吸附柱CB3中加入600μL漂洗液PW(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),12,000rpm(13,400×g)離心30sec,倒掉廢液,吸附柱CB3放入收集管中; 9.重複操作步驟8; 10.將吸附柱CB3放回收集管中,12,000rpm(13,400×g)離心2min,倒掉廢液。將吸附柱CB3置於(yu) 室溫放置數分鍾,以徹di晾幹吸附材料中殘餘(yu) 的漂洗液。注意:這一步的目的是將吸附柱中殘餘(yu) 的漂洗液去除,漂洗液中乙醇的殘留會(hui) 影響後續的酶反應(酶切、PCR等)實驗; 11.將吸附柱CB3轉入一個(ge) 幹淨的離心管中,向吸附膜的中間部位懸空滴加50-200μL洗脫緩衝(chong) 液TE,室溫放置2-5min,12,000rpm(13,400×g)離心2min,將溶液收集到離心管中。注意:洗脫緩衝(chong) 液體(ti) 積不應少於(yu) 50μL,體(ti) 積過小影響回收效率。洗脫液的pH值對於(yu) 洗脫效率有很大影響。若用ddH2O做洗脫液應保證其pH值在7.0-8.5範圍內(nei) ,pH值低於(yu) 7.0會(hui) 降低洗脫效率;且DNA產(chan) 物應保存在-20℃,以防DNA降解。為(wei) 增加基因組DNA的得率,可將離心得到的溶液再加入吸附柱CB3中,室溫放置2min,12,000rpm(13,400×g)離心2min; |
生長條件 | 37℃;18-24h;好氧; |
存儲(chu) 條件 | 2-8℃ |