xGen™ cfDNA & FFPE DNA 文庫製備試劑盒產品詳情

應用

xGen cfDNA & FFPE DNA 文庫製備機械剪切試劑盒 v2 可製備適用於(yu) 使用降解樣本的多類研究應用的二代測序 (NGS) 文庫，這些應用包括：

• 低頻體(ti) 細胞變異 SNP 識別

• 插入/缺失 (insertions/deletion, indel)

• 識別遺傳(chuan) 種係 SNP 和 indel

• 全基因組測序 (WGS)

xGen cfDNA & FFPE DNA 文庫製備實驗方案需要大約 4 個(ge) 小時，僅(jin) 包括四個(ge) 主要步驟，充分減少了樣本處理操作（圖 1）：

• 末端修複。 末端修複酶混合物將 cfDNA 或剪切過的起始 DNA（如 FFPE DNA）轉化為(wei) 可用於(yu) 連接的平末端 DNA。

• 連接 1。 在連接 1 酶的催化作用下，將連接 1 接頭單鏈添加到剪切 DNA 片段的 3' 端。這種新型酶不能將插入片段連接起來，可充分減少嵌合體(ti) 的形成。連接 1 接頭的 3' 端還含有一個(ge) 封閉基團，以防止形成接頭二聚體(ti) 。

• 連接 2。 連接 2 接頭充當引物，與(yu) 連接 1 接頭互補，填充堿基間隙，然後連接到 DNA 插入片段的 5′ 端，以形成雙鏈產(chan) 物。

• PCR 擴增。 包含 xGen 2x HiFi PCR 混合液，用於(yu) 執行加標簽 PCR（引物單獨出售），以便於(yu) 進行 Illumina® 測序。

圖 1. xGen cfDNA & FFPE DNA 文庫製備 v2 機械剪切試劑盒工作流程。 在第一步中，末端修複酶將 cfDNA 或剪切過的起始 DNA 轉化為(wei) 可用於(yu) 連接的平末端 DNA。然後，在連接 1 酶的催化作用下，將連接 1 接頭單鏈添加到 DNA 插入片段的 3′ 端。這種新型酶不能將插入片段連接起來，可充分減少嵌合體(ti) 的形成。連接 1 接頭的 3' 端還含有一個(ge) 封閉基團，以防止形成接頭二聚體(ti) 。連接 2 接頭充當引物，與(yu) 連接 1 接頭互補，填充堿基間隙，然後連接到 DNA 插入片段的 5′ 端，形成雙鏈產(chan) 物。在最後一步中，通過 IDT 2x HiFi PCR 混合液進行 PCR，在片段上加上樣本標簽序列，以便在 Illumina® 平台上測序。

技術詳情

xGen cfDNA & FFPE DNA 文庫製備 v2 機械剪切試劑盒包括末端修複、連接 1 和連接 2 反應以及 PCR 所需的所有試劑。

表 1. 規格參數、更多試劑和設備。

雜交捕獲研究實驗的完整流程

xGen cfDNA & FFPE DNA 文庫製備 v2 機械剪切試劑盒經過優(you) 化，可與(yu) xGen 雜交捕獲探針和試劑無縫配合使用（圖 2）。無論您的項目需要全外顯子組測序還是定製探針組，IDT 均可提供適合您的捕獲解決(jue) 方案。

圖 2. 雜交捕獲和測序研究工作流程概覽。

Syntezza Biosescience 成立於(yu) 2003 年，專(zhuan) 注於(yu) 在以色列提供先進的分子生物學產(chan) 品和測序服務，我們(men) 是以色列的供應商。 Syntezza 為(wei) 學術和政府研究機構、醫院和 HMO 以及製藥、農(nong) 業(ye) 、環境、生物技術和醫療診斷行業(ye) 的企業(ye) 客戶提供服務。Syntezza經銷IDT-Integrated DNA Technologies全係列DNA、RNA和CRISPR產(chan) 品，IDT和MGI的NGS Library Prep試劑盒，GRiSP的研究試劑，BioBasic的定製基因和肽，BioBasic的定製mRNA和庫存產(chan) 品TriLink、GenTegra 的 DNA 和 RNA 穩定試劑盒以及內(nei) 部開發的研究試劑。