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用於靶向 DNA 和 RNA 測序的 CleanPlex 擴增子測序技術

更新時間:2024-03-08      點擊次數:540

CleanPlex ®是一種超可擴展且超靈敏的NGS 擴增子測序技術。它具有高度先進的專(zhuan) 有多重 PCR 引物設計算法、極其均勻的多重 PCR 擴增化學物質 和 創新的背景清潔化學物質。它們(men) 共同使得 CleanPlex 即用型和定製 NGS 麵板能夠突破傳(chuan) 統的基於(yu) 擴增子和基於(yu) 混合捕獲的目標富集技術的限製。


功能亮點:

  • 超高的擴增均勻性和超低的PCR背景噪音(更準確的變異調用或更低的測序成本)

  • 單管 3 小時工作流程,手動操作時間最少(輕鬆自動化)

  • 兼容困難樣品(降解的FFPE DNA、FFPE RNA、cfDNA、cfRNA)和主要測序平台(Illumina、Ion Torrent、Genapsys、MGI DNBSeq)

  • 高的靈敏度(低至單細胞水平直接擴增*)

  • 出色的麵板大小可擴展性,單個(ge) 多重 PCR 池中的擴增子數可達 20,000 多個(ge)

  • 檢測和分析單核苷酸變異(SNV)、小插入和缺失(Indels)、拷貝數變異(CNV)、基因融合/剪接變異、基因表達水平、腫瘤突變負荷(TMB)、微衛星不穩定性(MSI)、內(nei) 部串聯複製(ITD)等

具體(ti) 來說,擴增子測序技術提供了一種專(zhuan) 注於(yu) 特定基因或特定感興(xing) 趣基因組區域的靶向方法。
全基因組測序(WGS)及其相應的全基因組擴增(WGA)方法更適合研究和發現類型的應用,而靶向測序或靶向基因測序對於(yu) 許多快速增長的臨(lin) 床和工業(ye) 應用至關(guan) 重要,這些應用的成本和速度都受到限製。更重要。

基因組學界麵臨(lin) 的挑戰之一是持續獲取大量測序原始數據,這些數據尚未全成功地翻譯和解釋,以幫助在更廣泛的範圍內(nei) 推進研究、診斷和治療疾病。即使目前測序成本降低,全基因組測序方法實際上也隻能用於(yu) 基礎研究、群體(ti) 遺傳(chuan) 學或罕見疾病檢測等特定場景。有針對性的或有針對性的方法將更適合了解疾病進展並指導臨(lin) 床環境中的治療選擇或在工業(ye) 應用中大規模篩查 DNA 樣本。此外,就實驗室操作和用於(yu) 存儲(chu) 和處理大量數據的生物信息學基礎設施而言,對整個(ge) 基因組或外顯子組進行測序可能非常昂貴。因此,靶向測序對於(yu) 精準醫療和研究的持續進步變得至關(guan) 重要。

cleanplex DNA 擴增子測序工作流程

圖 2. CleanPlex DNA 靶標富集和文庫製備工作流程

cleanplex RNA 靶標富集文庫製備工作流程

圖 3. CleanPlex RNA 靶標富集和文庫製備工作流程































Paragon Genomics 總部位於(yu) 舊金山灣區,是一家快速發展的精準醫療公司。我們(men) 的靶向測序技術CleanPlex® DNACleanPlex® RNA、CleanPlex® UMIOmniFusion™為(wei) 精準腫瘤學、傳(chuan) 染病檢測、遺傳(chuan) 性疾病檢測、單細胞分析、分子育種和許多其他應用提供全麵的解決(jue) 方案。

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