據報道,每年因劣質抗體(ti) 造成的生物和醫學研究損失約為(wei) 8億(yi) 美元。此外,實驗結果不一致和抗體(ti) 重複性差的後果 是無法估計的。
國際抗體(ti) 驗證工作組(IWGAV)於(yu) 2016年9月發表題為(wei) 《 自然方法 中 抗體(ti) 驗證的建議》的文章 ,強調抗體(ti) 驗證應根據目標蛋白的相應應用和背景進行。作者提出了抗體(ti) 驗證的五個(ge) 概念支柱:(i)遺傳(chuan) 策略,(ii)正交策略,(iii)獨立抗體(ti) 策略,(iv)標記蛋白的表達,以及(v)免疫捕獲後進行質譜分析。多發性硬化症)。
這五種方法各有其優(you) 缺點以及適用條件。例如,遺傳(chuan) 策略通過比較細胞或組織中的相關(guan) 信號來評估抗體(ti) 特異性,其中使用 CRISPR-Cas9 或 RNA 幹擾 (RNAi) 敲除或敲低目標基因與(yu) 野生型 (WT) 對照的信號。盡管這種方法很簡單,但未能擊倒或敲除目標基因將大大損害該方法的實驗可行性。
免疫捕獲後進行質譜 (MS) 的方法可以識別與(yu) 純化抗體(ti) 直接相互作用的蛋白質, 以及與(yu) 目標蛋白質間接相互作用的其他蛋白質。 然而,這種方法依賴於(yu) 昂貴的科學儀(yi) 器和實驗材料。並非每個(ge) 實驗室都能負擔得起這些設備。
在 Affinity Biotech,抗體(ti) 通過 獨立抗體(ti) 驗證進行驗證。為(wei) 此,使用幾種抗體(ti) 來識別靶蛋白上的不同表位。具有最高特異性的抗體(ti) 是通過包括比較和定量分析的適當程序確定的。雖然大多數抗體(ti) 的檢測應該沒有問題,但對於(yu) 檢測特異性要求較高的抗體(ti) ,特別是那些位點特異性的磷酸化抗體(ti) ,仍然不夠。
結合多年的抗體(ti) 研發和生產(chan) 經驗,Affinity Biotech采用了更合適的抗體(ti) 驗證策略: 封閉 肽驗證。
封閉肽(抗原)與(yu) 抗體(ti) 一一對應。 。這是最原始的材料,隻有原廠才能提供。
首先,我們(men) 對封閉肽進行 MS 分析,以確保肽序列準確。
在蛋白質印跡分析中,肽會(hui) 阻斷目標抗體(ti) 的信號。沒有封閉肽的泳道用作對照。封閉肽將與(yu) 靶蛋白競爭(zheng) 結合位點,從(cong) 而在封閉基團中不留下特異性條帶。
該策略目前用於(yu) 驗證我們(men) 的抗體(ti) 。它對於(yu) 磷抗體(ti) 的生產(chan) 至關(guan) 重要,因為(wei) 它確保了磷抗體(ti) 的位點特異性。換句話說,磷酸化抗體(ti) 隻能識別相應位點的磷酸化靶蛋白。非磷酸化的目標蛋白或其他位點磷酸化的目標蛋白將不會(hui) 被識別。
舉(ju) 個(ge) 例子。在 Phospho-MSK1 (Ser211) Antibody(貨號 AF7155)的蛋白質印跡驗證中,泳道 1 和泳道 3 中分別添加了非磷酸化阻斷肽和磷酸化阻斷肽。 2號車道沒有被封閉。結果顯示,使用磷酸化肽封閉目標蛋白後,沒有檢測到目的條帶。