用於 DNA 和 RNA 測序的 CleanPlex 擴增子測序

CleanPlex ®是一種超可擴展且超靈敏的NGS 擴增子測序技術。它具有高度先進的專(zhuan) 有多重 PCR 引物設計算法、極其均勻的多重 PCR 擴增化學物質 和 創新的背景清潔化學物質。它們(men) 共同使得 CleanPlex 即用型和定製 NGS 麵板能夠突破傳(chuan) 統的基於(yu) 擴增子和基於(yu) 混合捕獲的目標富集技術的限製。

功能亮點：

• 超高的擴增均勻性和超低的PCR背景噪音（更準確的變異調用或更低的測序成本）

• 單管 3 小時工作流程，手動操作時間最少（輕鬆自動化）

• 兼容困難樣品（降解的FFPE DNA、FFPE RNA、cfDNA、cfRNA）和主要測序平台（Illumina、Ion Torrent、Genapsys、MGI DNBSeq）

• 高的靈敏度（低至單細胞水平直接擴增*）

• 出色的麵板大小可擴展性，單個(ge) 多重 PCR 池中的擴增子數可達 20,000 多個(ge)

• 檢測和分析單核苷酸變異（SNV）、小插入和缺失（Indels）、拷貝數變異（CNV）、基因融合/剪接變異、基因表達水平、腫瘤突變負荷（TMB）、微衛星不穩定性（MSI）、內(nei) 部串聯複製（ITD）等

以下是 CleanPlex DNA 擴增子測序文庫製備的典型工作流程（圖 2）。 CleanPlex DNA 工作流程涉及 3 個(ge) 簡單步驟，每個(ge) 步驟包括熱循環或孵育反應，然後使用磁珠進行文庫純化。簡化的方案僅(jin) 需 3 小時即可完成。在步驟 1 中，在多重 PCR 反應中擴增感興(xing) 趣的靶標。在步驟 2 中，引物二聚體(ti) 、非特異性 PCR 產(chan) 物和複雜的分子碎片在具有創新和專(zhuan) 有 CleanPlex 背景清潔化學的消化反應中被生化去除。在步驟 3 中，通過 PCR 索引反應為(wei) 文庫添加樣本索引條形碼。輸入材料可以是基因組 DNA 和從(cong) FFPE、新鮮/冷凍組織或血液活檢中提取的 DNA。通過在前麵添加逆轉錄步驟，輸入材料也可以是RNA。 （圖3）