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ELISA、免疫 PCR 與 SIMOA:蛋白質檢測工具的比較

更新時間:2023-08-03      點擊次數:2187

介紹

ELISA(酶聯免疫吸附測定)是蛋白質檢測的“金標準"方法。1在本博客中,回顧了三種流行的 ELISA 平台:標準 ELISA免疫 PCR單分子陣列 (SIMOA)。我們(men) 將對這些 ELISA 的設計原理、樣本量、儀(yi) 器和靈敏度進行比較。

ELISA 的工作原理

ELISA的基本設計原理取決(jue) 於(yu) 抗體(ti) -抗原相互作用的穩定性和特異性。簡而言之,固定在珠子或微孔板等固體(ti) 基質上的捕獲抗體(ti) 可與(yu) 多種樣品類型中的目標蛋白結合。此類樣品可包括血漿、血清、細胞和組織裂解物、條件培養(yang) 基或尿液

1971 年引入 ELISA 時,酶標記抗原被纖維素顆粒上的抗體(ti) 捕獲。2然後通過反複離心和洗滌分離抗體(ti) -抗原綴合物。此後,不同的 ELISA 格式被開發出來,包括夾心 ELISA,其中目標蛋白“夾在"捕獲抗體(ti) 和標記檢測抗體(ti) 之間(圖 1)。這種 ELISA 格式具有高度特異性,因為(wei) 需要兩(liang) 種抗體(ti) 與(yu) 蛋白質結合才能進行檢測。此外,可以用標準曲線確定蛋白質濃度(即定量數據)。image.png

圖 1. 夾心 ELISA 使用兩種抗體來靶向蛋白質,從而具有高特異性。


這裏討論的 ELISA 平台——標準 ELISA免疫 PCR單分子陣列 (SIMOA) ——是生成定量數據的夾心 ELISA。然而,它們(men) 在底物、檢測方法、儀(yi) 器、樣品體(ti) 積和靈敏度方麵有所不同。


標準酶聯免疫吸附試驗

標準 ELISA (sELISA) 將捕獲抗體(ti) 固定到透明塑料 96 孔微孔板上(圖 2、表 1)。該檢測抗體(ti) 與(yu) 辣根過氧化物酶 (HRP) 結合,該酶可將其底物 3,3',5,5'-四甲基聯苯胺 (TMB) 還原為(wei) 藍色和氧化形式。顏色的變化與(yu) HRP 的量成正比,並且推論與(yu) 樣品中目標蛋白的量成正比。添加硫酸可終止 HRP-TMB 反應,導致顏色從(cong) 藍色變為(wei) 黃色。使用酶標儀(yi) 在 450 nm 處測量吸光度


圖 2. 標準 ELISA 的工作原理。標準 ELISA 使用 HRP 偶聯的檢測抗體和比色底物來檢測捕獲的蛋白質。

標準免疫PCRSIMOA
基質96孔微孔板96孔PCR板珠子
檢測方法比色法聚合酶鏈式反應熒光
樂器讀板器實時熒光定量PCR儀專用儀器
樣品量*100微升10-25 µL125微升
靈敏度高的更高最高

表 1. 標準 ELISA、免疫 PCR 和單分子陣列 (SIMOA) 的比較。 * = 樣品稀釋後每次重複的最終體(ti) 積。

sELISA 的靈敏度一般範圍為(wei) 1 pg/ml 至 100 pg/ml。然而,一些 sELISA 的定量限 (LLOQ) 低至亞(ya) pg/ml 或高達 10 ng/ml。與(yu) 所有 ELISA 一樣,靈敏度取決(jue) 於(yu) 所用抗體(ti) 的靈敏度。

對於(yu) 標準 96 孔板,最終樣品體(ti) 積為(wei) 每孔 100 µL。使用“半麵積"板可以減少體(ti) 積 (50 µL) ,其中孔的直徑為(wei) 一半寬,但測定靈敏度也可能會(hui) 降低。用於(yu) 任何ELISA 的原始樣品體(ti) 積將取決(jue) 於(yu) 最佳樣品稀釋度,該稀釋度會(hui) 因蛋白質、樣品類型和實驗而異。

將樣品添加到板中後,大約 5 小時內(nei) 即可獲得結果。然而,當樣品和抗體(ti) 同時添加到板中時,可以實現更快的周轉時間。這減少了孵育步驟和洗滌步驟的數量。例如,SpeedELISA的處理時間為(wei) 3 小時,在添加樣品之前同時孵育板上的捕獲檢測抗體(ti) 。其他方法包括一步添加樣品和兩(liang) 種抗體(ti) ,或者將樣品和檢測抗體(ti) 一起添加。然而,減少處理時間會(hui) 降低靈敏度(圖 3)。

圖 3. 多步 sELISA 和SpeedE LISA 在靈敏度和檢測範圍方麵的比較。針對人 (A) CD26 和 (B) 可溶性 IL-6 受體 (IL-6 sR) 的標準曲線數據。兩種測定均使用相同的標準品和抗體對。使用 RayBiotech Life, Inc.(Peachtree Corners,GA;美國)的 sELISA 和 SpeedELISA 試劑盒對人 CD26 和 IL-6 sR 進行分析(CD26:sELISA 試劑盒貨號 ELH-CD26,SpeedELISA 試劑盒貨號 ELHS-CD26)( IL-6 sR:sELISA 試劑盒目錄號 ELH-IL6sR,SpeedELISA 試劑盒目錄號 ELHS-IL6sR)。 OD = 光密度。

sELISA 的主要優(you) 點是提供低成本試劑盒,可以針對來自多個(ge) 物種的數千種不同蛋白質。此外,sELISA 幾乎不需要培訓,可生成易於(yu) 解釋的數據,並使用與(yu) 其他檢測兼容的經濟實惠的酶標儀(yi) 。這些優(you) 點導致 sELISA 在研究中得到廣泛使用。

免疫PCR (IQELISA TM )

免疫 PCR也稱為(wei) 免疫定量 ELISA (IQELISA),將捕獲抗體(ti) 粘附到塑料 96 孔 PCR 板上,同時檢測抗體(ti) 與(yu) DNA 條形碼綴合(圖 4、表 1)。使用 PCR,雙鏈 (ds) DNA 條形碼在條形碼特異性引物和與(yu) dsDNA 結合的熒光染料存在的情況下分別被擴增和染色。熒光與(yu) dsDNA 的量成正比,因此也與(yu) 樣品中目標蛋白的量成正比。使用實時 PCR 儀(yi) 器測量熒光。

圖 4. 免疫 PCR 的工作原理。免疫 PCR 使用 DNA 條形碼檢測抗體和 dsDNA 熒光染料來檢測捕獲的蛋白質。

IQELISA 的一個(ge) 優(you) 點是其體(ti) 積要求小,每次重複的最終體(ti) 積僅(jin) 為(wei) 10 µL。因此,當樣品量有限或難以獲得樣品時,IQELISA 是一個(ge) 特別有吸引力的選擇。然而,IQELISA 比 sELISA 在技術上更具挑戰性,因為(wei) 它需要更精確的移液。此外,樣品應至少重複三次,因為(wei) 小體(ti) 積會(hui) 增加異常值的機會(hui) 。

DNA 通過 PCR 擴增循環呈指數增長。因此,與(yu) 使用相同抗原和抗體(ti) 對的 sELISA 相比,IQELISA 的 LLOQ 平均增加了 23 倍。靈敏度的增加取決(jue) 於(yu) 抗體(ti) ,範圍從(cong) 無變化到 105 倍(圖 5)。

從(cong) 樣品孵育到數據收集,IQELISA 大約需要 5.5 小時。該周轉時間與(yu) sELISA 類似。

圖 5. sELISA 和免疫 PCR 對 28 種蛋白質的敏感性比較。 sELISA 和免疫 PCR ELISA 均使用每個靶標的相同標準品和抗體對。該圖和圖 8 使用相同的 RayBiotech Life, Inc. 的 sELISA 試劑盒和 IQELISA 試劑盒。

單分子陣列 (SIMOA TM )

SIMOA是一種超靈敏 ELISA,使用抗體(ti) 包被的珠子和熒光偶聯的檢測抗體(ti) (圖 6、表 1)。將珠子、樣品和檢測抗體(ti) 混合在一起後,將溶液施加到具有超過 235,000 個(ge) 微孔的卡盒中。每個(ge) 微孔隻能容納一顆珠子。然後將油添加到卡盒中,將樣品推過微孔陣列的表麵並形成孔的液密密封。

使用配備熒光顯微鏡的全自動或半自動係統測量熒光;該儀(yi) 器由 SIMOA( Quanterix ;Billerica,MA;美國)開發商製造。由於(yu) 每個(ge) 孔隻能包含一個(ge) 珠子,因此具有熒光的微孔的數量與(yu) 樣品中目標蛋白的量成正比。這使得單分子檢測成為(wei) 可能。

圖 6. 單分子陣列的工作原理。 SIMOA 使用熒光偶聯檢測抗體和微孔來檢測捕獲的蛋白質。

SIMOA 的一個(ge) 關(guan) 鍵優(you) 勢是它可以檢測飛摩爾範圍內(nei) 的蛋白質。也就是說,靈敏度通常在 10 fg/ml 至 1 pg/ml 範圍內(nei) 。與(yu) sELISA 和 IQELISA 相比,SIMOA 的平均靈敏度分別提高了 465 倍和 63 倍。

將試劑裝入 Quanterix 儀(yi) 器後,大約需要 3 小時才能獲取數據。因此,SIMOA 的程序時間比 sELISA 和 IQELISA 都短。

雖然 SIMOA 實現了此處評測的三個(ge) 平台中的一些最高靈敏度,但該技術也有一些缺點。首先,目前使用該技術分析的蛋白質數量很少(~165)。其次,SIMOA 試劑盒的成本高於(yu) sELISA 和 IQELISA 試劑盒。第三,檢測儀(yi) 器價(jia) 格昂貴,且隻能用於(yu) SIMOA,是專(zhuan) 用儀(yi) 器,需要專(zhuan) 門培訓才能運行。

圖 7. sELISA 和 SIMOA 在靈敏度和檢測範圍方麵的比較。通過將純化的人(A) IL-6 或(B) TNA α 添加到緩衝液中生成標準曲線數據。 RayBiotech Life, Inc. 的每個靶標的相同標準品和抗體對用於 sELISA 和 SIMOA(IL-6,sELISA 目錄號 ELH-IL6;TNF α,sELISA 目錄號 ELH-TNF)。 Y 軸 = 標準化信號,其中減去空白信號。信號 = sELISA 450 nm 處的 OD 或 SIMOA 的每珠平均酶 (AEB)。空白=不含目標蛋白的緩衝液。

多重ELISA

值得一提的是,IQELISA 和 SIMOA 分別可以同時分析多達 3 個(ge) 和 6 個(ge) 目標。除了需要更少的樣品之外,在分析相同數量的蛋白質時,多重檢測通常比單重檢測更具成本效益。重要的是,多重檢測會(hui) 降低 IQELISA 的靈敏度,而使用SR-X TM生物標誌物檢測係統的SIMOA 則不會(hui) 影響靈敏度

還提供其他定量多重 ELISA 選項,包括 Quantibody® 和 RayPlex TM 抗體(ti) 陣列Quantibody可以使用 100 µL 稀釋樣品在 6 小時內(nei) 分析多達 40 種蛋白質,一式四份。使用兼容的激光掃描儀(yi) 采集數據RayPlex可以使用流式細胞術在 4 小時內(nei) 每次重複使用 25 µL 稀釋樣品測量多達 25 種蛋白質。兩(liang) 種抗體(ti) 陣列的靈敏度與(yu) sELISA 相似。

在我們(men) 的博客“使用抗體(ti) 陣列進行多重蛋白質檢測"或我們(men) 的視頻“為(wei) 您的研究識別正確的抗體(ti) 陣列"中了解如何確定用於(yu) 多重蛋白質檢測的正確抗體(ti) 陣列。

概括

標準 ELISA、免疫 PCR (IQELISA) 和 SIMOA 相互比較時具有優(you) 點和缺點:

  • sELISA是一種簡單的比色測定法,數據易於(yu) 解釋,因此幾乎不需要培訓。使用能夠測量 450 nm 吸光度的酶標儀(yi) 在 5 小時內(nei) 獲得數據。使用比 IQELISA 和 SIMOA 試劑盒便宜的試劑盒可以靶向數千種不同的蛋白質。然而,與(yu) IQELISA 和 SIMOA 相比,sELISA 的靈敏度低。

  • 免疫PCR使用實時PCR儀(yi) 器,在6小時內(nei) 收集數據。在此介紹的三個(ge) ELISA 平台中,它的體(ti) 積要求低,但比 sELISA 需要更多的移液和數據分析技術專(zhuan) 業(ye) 知識。平均而言,其靈敏度比 sELISA 高 23 倍。可以同時檢測 3 種蛋白質,但檢測靈敏度會(hui) 降低。

  • SIMOA的靈敏度最高,其靈敏度平均分別比 sELISA 和 IQELISA 提高了 465 倍和 63 倍。使用需要專(zhuan) 門培訓的昂貴專(zhuan) 用儀(yi) 器可在 3 小時內(nei) 獲得數據。它還需要比 sELISA 和 IQELISA 更多的樣本量。一次可以分析多達 6 種蛋白質,而不會(hui) 影響靈敏度。

圖 8 表明,對於(yu) 許多蛋白質,LLOQ 的總體(ti) 改進遵循以下趨勢:SIMOA > IQELISA > sELISA。不過,也有例外。例如,IQELISA 對人 IL-1β 的靈敏度最高,為(wei) 0.0064 pg/ml,而 sELISA 和 SIMOA 的 LLOQ 分別為(wei) 0.3 和 0.04 pg/ml。

圖 8. sELISA、免疫 PCR 和 SIMOA 之間靈敏度倍數增加的比較。 RayBiotech Life, Inc. 的每個靶標的相同標準品和抗體對用於所有平台。目標包括 28 種人類蛋白質、3 種小鼠蛋白質和 1 種大鼠蛋白質。(A) 17 種蛋白質的靈敏度提高了 0 – 100 倍;不包括(B)或(C)中的蛋白質。(B)九種蛋白質的敏感性增加了 0 – 1,000 倍;不包括(A)或(C)中的蛋白質。(C)兩種蛋白質的敏感性增加了 0 – 10,000 倍;不包括(A)或(B)中的蛋白質。 Y 軸 = 與 X 軸下方描述的第二 ELISA 平台相比,第一個 ELISA 平台的靈敏度增加倍數。水平線=中位數。

結論

最常見的蛋白質檢測工具之一是 ELISA。在這裏,我們(men) 比較了三種流行的夾心 ELISA 平台:標準 ELISA免疫 PCR單分子陣列 (SIMOA)。在為(wei) 研究選擇合適的 ELISA 時,其底物、檢測方法、儀(yi) 器、樣品量、靈敏度和成本是重要的考慮因素。標準 ELISA 是流行的方法,因為(wei) 可以使用低成本 試劑盒來靶向來自多個(ge) 物種的數千種不同蛋白質。此外,它幾乎不需要培訓即可運行,其數據易於(yu) 解釋,並且使用非專(zhuan) 用 酶標儀(yi) 與(yu) 其他測定兼容。一個(ge) 關(guan) 鍵要點是 ELISA 靈敏度和成本之間需要權衡:靈敏度越高,成本越高。成本考慮了套件、培訓、勞動力和所需儀(yi) 器的價(jia) 格。因此,sELISA 是實惠的選擇,而 SIMOA 是最敏感的。

對於(yu) 不具備必要的專(zhuan) 業(ye) 知識或設備來使用此處討論的 ELISA 平台分析樣品的實驗室,RayBiotech Life, Inc. 提供完整的測試服務。該服務提供完整的報告,包括原始數據、標準曲線和定量數據。蛋白質濃度。





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